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代谢组学数据分析及多元统计分析与应用培训班

代谢组学是通过比较对照组和实验组,以寻找代谢谱差异的研究方法,近年来,代谢组学在疾病诊断,病理研究,新药开发,药物毒理学,动植物、微生物,营养学等医学与人类健康和疾病密切相关的领域有着广泛的应用,且越来越多的生命科学研究工作者选择代谢组学平台进行科学研究。
因此,我们特邀请了几位一线专家,从代谢组实验演练,从前处理-->上机检测--> 生物信息分析的培训流程,通过理论和实践的结合,与学员近距离的交流和指导,希望能给大家带来新的知识和技术,让学员在短时间内能够自主开展代谢组项目。希望学员、讲师在共同的学习时间里,能够建立良好的交流与合作关系。

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第一天,代谢组学下机数据分析及相关软件的使用
主讲人:纪剑(江南大学),组学派创始人之一

当前主要研究方向为基于GCMS的代谢组学方法学研究,食品安全与代谢毒理、质谱代谢组学、真菌毒素联合毒性。迄今为止已在国内外重要学术刊物发表研究论文40余篇。

基于MS DIAL软件的质谱数据分析及物质鉴定
  1- 从原始质谱数据到代谢物数据矩阵步骤与方法简介
  2- MS DIAL软件处理GCMS 下机数据(数据实战演练)
    - MS DIAL界面介绍及功能使用介绍
    - 使用脂肪酸甲酯FAMEs计算保留指数RI
    - GCMS数据库介绍及物质鉴定的关键技巧
    - 解卷积、峰对齐、零填充的介绍及使用技巧
  3- MS DIAL软件处理LCMS下机数据(数据实战演练)
    - LCMS下机原始质谱数据转换和数据分析
    - 通过质谱数据库(MoNA、NIST)鉴定LCMS检测的代谢物
    - 通过in-silico fragmentation工具鉴定未知结构代谢物

 

第二天,多元统计分析及机器学习在代谢组学中的应用培训 
主讲人:黄琳(上海交通大学)

课程案例:
多元变量统计分析方法介绍、生物标志物筛选、
多元统计分析及机器学习结合代谢组学的疾病诊断 
培训内容如下: 
1.如何使用多元变量统计分析方法发现数据中的价值 
2.使用PCA和OPLS-DA等模型对数据进行解读 
3.潜在小分子生物标记物的发现 
4.Metaboanalyst在线工具的介绍 
5.Metaboanalyst在线工具的使用
6.机器学习在代谢组学中的介绍及应用

注意:小班上机授课,请自备笔记本电脑,并在开班前根据培训班开班通知,安装相关软件!

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图1 MS DIAL提峰解卷积功能(GCMS或LCMS数据)

图2 MS DIAL 峰对齐和0值填充功能(软件工作界面)
图3 MS DIAL可以处理任何质谱数据并匹配所有的msp格式数据库

图4 GC代谢组学高质量鉴定和峰对齐结果
图5 SIMCA数据导入界面
图6 metaboanalyst在线工具介绍及应用
图7 Orange可视化机器学习界面

全国高校和科研院所具有相关领域背景的教师、研究人员和在读研究生。
有科研需求的临床医生。
希望通过大数据分析,提炼并研究科学问题的科研人员,尤其是研究中涉及到组学、临床数据等多变量信息的研究者。

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注册费用
注册类型 10月31日前到款 10月31日后到款 注册费包含
科研院所人员  3200 RMB/人  3500 RMB/人 会议资料、午餐
学生 2900 RMB/人 3200 RMB/人

三人或以上一同报名,即可享受团队价格,在原培训费价格基础上各减免300元!
在线注册成功后,将有工作人员马上与您联系沟通。

培训地点:北京好特热温泉酒店(地处丰台区方庄商圈,近三环路)
报名咨询:张依寒 13681810839   微信同号
邮箱:zhang.yihan@foxmail.com; wservice@acadeevent.com

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