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高通量芯片及测序技术的快速发展和应用积累了海量的生物学数据，多个数据库诸如GEO、TCGA、ArrayExpress等被建立用来存储、查询以及分析挖掘有意义的生物信息。这些数据库具有免费、公开、操作界面友好的特点，几乎覆盖了所有器官、组织、细胞相关的基因组、转录组、表观组、蛋白质组等数据。了解这些数据库，掌握数据挖掘的相关技巧将有助于我们快速寻找靠谱的研究靶点，提高科研的质量和效率，发表高质量的SCI论文，奠定基金申请所需的前期工作基础等。 |
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| 时间安排 |
课程表 |
介绍 |
| 2018年11月3日 |
| 09:00-10:20 |
生物数据挖掘与科研 |
- 生物数据挖掘概述
- 常规高通量检测技术介绍
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了解掌握生物大数据挖掘的背景知识 |
| 10:40-12:00 |
常用数据库 |
- 基因综合数据库NCBI
- 基因表达数据库GEO
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掌握生物数据解读、查找和存储的能力 |
| 13:30-15:00 |
差异表达分析 |
- 方法介绍
- 软件实现
- GEO2R工具
- 差异基因可视化
- 火山图、热图绘制
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无需编程，快速实现差异基因表达分析和可视化，掌握绘制火山图和热图的常规软件 |
| 15:20-17:00 |
功能富集分析 |
- 基本原理介绍
- GO与KEGG数据库
- 富集分析常用软件介绍
- 功能富集分析结果可视化及解读
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掌握GO、KEGG、DAVID等数据库的使用 |
| 2018年11月4日 |
| 09:00-10:20 |
基因/蛋白互作分析 |
- 基因/蛋白互作数据库介绍
- Cytoscape软件介绍与操作
- 网络拓扑性质分析
- 常用插件使用
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熟练运用Cytoscape绘制高质量的基因/蛋白互作网络图，并掌握利用网络拓扑性质实现关键靶点的挖掘策略 |
| 10:40-12:00 |
数据挖掘相关SCI文章解析 |
- 研究靶点挖掘策略
- 经典SCI文章套路解析
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经典文章解析进一步理解数据挖掘的相关思路 |
| 13:30-16:00 |
实操 |
- 基因和蛋白基本信息查找
- Blast序列比对
- Primer-BLAST PCR引物设计
- GEO数据库查找
- GEO2R软件应用
- 火山图绘制
- 热图绘制
- GO数据库查询
- KEGG数据库查询
- DAVID功能富集分析
- STRING数据库挖掘互作关系
- Cytoscape绘制基因互作网络
- 关键基因（hub节点）寻找
- MCODE子网络模块挖掘
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通过自己动手进一步理解高通量数据挖掘的理念，掌握常用软件的使用。 |
| 16:00-17:00 |
交流与答疑 |
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通过生信大数据分析，提炼并研究科学问题的科研人员、研究生、博士生
有科研需求的临床医生 / 企事业单位的研发技术人员 |
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1. 零基础入门级，无需生物信息学背景、无需编程能力，教你如何运用现有数据库挖掘有价值科研信息
2. 交互式数据分析和探索，从多个数据源获取数据，并将数据转化为可用的形式
3. 内容集中，通俗易懂，学完能够快速上手
4. 理论与实操相结合，注重思路与案例带教齐头并进 |
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陈博士，北京协和医学院博士毕业，目前在大型综合三甲医院专职科研，发表SCI论文十余篇，擅长生物信息学与基础医学交叉研究、数据库信息挖掘及数据可视化。 |
1. 学会利用现有公共数据库挖掘相关疾病潜在靶点的思路
2. 掌握实现数据挖掘的关键软件
3. 数据可视化及高质量科研图片绘制 |
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| 注册类型 |
10月19日前到款 |
10月19日后到款 |
注册费包含 |
| 科研院所人员 |
3200 RMB/人 |
3500 RMB/人 |
会议资料、午餐 |
| 学生 |
2900 RMB/人 |
3200 RMB/人 |
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三人或以上一同报名，即可享受团队价格，在原培训费价格基础上各减免300元！
在线注册成功后，将有工作人员马上与您联系沟通。
培训地点：北京好特热温泉酒店（地处丰台区方庄商圈，近三环路）
报名咨询：张依寒 13681810839
微信同号
邮箱：zhang.yihan@foxmail.com; wservice@acadeevent.com |
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