王永明

王永明

复旦大学

研究员,博士生导师,2015年国家青年千人获得者。
近期在Circulation Research,Journal of the American College of Cardiology,Nucleic Acids Research,Scientific Reports和 PlOS Genetics等杂志发表重要文章。

演讲报告题目摘要:

建立高效的CRISPR/Cas9编辑技术
CRISPR/Cas9是一项革命性的基因编辑技术,得到广泛应用。我们从两个方面着手提高CRISPR/Cas9的编辑效率。我们利用附着体载体表达Cas9和gRNA,称之为epiCRISPR技术。附着体载体不整合到基因组,但是可以随着细胞的分裂而复制,因而可以长期的表达外源基因,实现长期的基因编辑。同时在附着体载体上表达嘌呤霉素抗性基因,可以富集转染成功的细胞。编辑完成后撤除筛选药物,附着体质粒迅速丢失,编辑后的细胞不再表达外源基因。利用附着体技术可以实现高达100%编辑效率,还可以高效的敲除基因组大片段,以及同时敲除多个基因。CRISPR/Cas9编辑效率受gRNA序列影响,不同的gRNA效率差别很大,测试gRNA效率费时费力。我们建立了高通量的测试gRNA活性的方法,得到了5万多条gRNA的活性,覆盖了2万多个人类基因。这些工作将会极大的方便基因编辑工作。

研究方向:

主要从事基因编辑技术的开发和应用研究。率先将基因编辑技术应用到心血管领域,制作了稳定表达报告基因的干细胞系,实现了对干细胞及其衍生细胞稳定的分子影像学分析;制作了长QT综合征干细胞模型,并证明模型可以用于筛药。近期从两个方面提高CRISPR/Cas9编辑效率,1)构建了高效的基因编辑系统,2)测试了数万个gRNA活性,并建立了针对SpCas9和两个高特异性Cas9突变体的gRNA活性预测模型。

学习和工作经历:

1997-2001年就读兰州大学生命科学学院并获得学士学位
2001-2004年就读东北师范大学生命科学学院并获得硕士学位
2005-2010年在德国马克斯-德尔布吕克分子医学中心(MDC)做博士生研究,并获得柏林自由大学博士学位
2010-2013年在斯坦福大学医学院从事博士后研究
2013年至今历任复旦大学生命科学学院青年研究员、研究员。

近期发表论文:

  1. Wang YM*, Pryputniewicz-Dobrinska D*, Nagy EE*, Kaufman CD*, Singh M, Yant S, Wang J, Dalda A, Kay MA, Ivics Z, Izsvak Z. Regulated complex assembly safeguards the fidelity of Sleeping Beauty transposition. Nucleic Acids Research. 2017 Jan; 45(1):311-326 (IF: 8.2).
  2. Qi JL*, Dong ZJ*, Shi YW, Wang X, Qin YY, Wang YM, Liu D. NgAgo-based fabp11a gene knockdown causes eye developmental defects in zebrafish. Cell Research. 2016 Dec; 26(12): 1349-1352 (IF: 14.8).
  3. He ZH*, Sun S*, Waqas M, Zhang XL, Qian FP, Cheng C, Zhang MS, Zhang SS, Wang YM, Tang ML, Li HW, Chai RJ. Reduced TRMU expression increases the sensitivity of hair-cell-like HEI-OC-1 cells to neomycin damage in vitro. Scientific Reports. 2016 Jul; 13;6: 29621 (IF: 5.2).
  4. Wang YM*, Liang P*, Lan F*, Wu HD*, Lisowski L, Gu MX, Hu SJ, Kay MA, Urnov FD, Shinnawi R, Gold J, Gepstein L, Wu JC. Genome editing of isogenic human induced pluripotent stem cells recapitulates long QT phenotype for drug testing. Journal of the American College of Cardiology. 2014 Aug; 64 (5): 451-459 (IF: 14.1).
  5. Wang YM*, Wang JC*, Chen JX, Deveraj A, Selbach M, Ivics Z and Izsvak Z. Suicidal autointegration of Sleeping Beauty and piggyback transposons in eukaryotic cells. PlOS Genetics. 2014 Mar; 10(3): e10043103 (IF: 8.5).
  6. Liang P*, Lan F*, Lee AS*, Gong TY, Sanchez-Freire V, Wang YM, Nguyen PK, Bers D, Robbins RC, Wu JC. Drug screening using a library of human induced pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes reveals disease specific patterns of cardiotoxicity. Circulation. 2013 Apr; 127(16): 1677-91 (IF: 15.2).
  7. Hu SJ, Wilson KD, Ghosh Z, Han L, Wang YM, Lan F, Ransohoff KJ, Wu JC. MicroRNA-302 increases reprogramming efficiency via repression of NR2F2. Stem Cells. 2013 Feb; 31(2):259-68 (IF: 7.7).
  8. Lan F*, Lee AS*, Liang P*, Sanchez-Freire V, Nguyen PK, Wang L, Han L, Yen M, Wang YM, Sun N, Abilez OJ, Hu SJ, Ebert AD, Navarrete EG, Simmons CS, Wheeler M, Pruitt B, Lewis R, Yamaguchi Y, Ashley EA, Bers DM, Robbins RC, Longaker MT, Wu JC. Abnormal Calcium Handling Properties Underlie Pathogenesis of Familial Hypertrophic Cardiomyopathy in Patient-Specific Induced Pluripotent Stem Cells. Cell Stem Cell. 2013 Jan; 12(1) 101-13. (IF: 25.3).
  9. Wang YM Zhang WY, Hu S, Lan F, Lee AS, Huber B, Lisowski L, Liang P, Huang M, de Almeida PE, Won JH, Sun N, Robbins RC, Kay MA, Urnov FD, Wu JC*.Genome editing of human embryonic stem cells and induced pluripotent stem cells with zinc finger nuclease for cellular imaging. Circulation Research. 111(12): 1494-503 (IF: 11.9).
  10. Nguyen PK, Lan F, Wang YM, Wu JC. Imaging: Guiding the clinical translation of cardiac stem cell therapy. Circulation Research. 2011;109:962-979 (IF: 9.5).
  11. Wang YM, Liska F*, Gosele C, Sedova L, Kren V, Krenova D, Ivics Z, Hubner N, and Izsvak Z. A novel active endogenous retrovirus family contributes to genome variability in rat inbred strains. Genome Research. 2010 Jan; 20(1) 19-27. (IF: 14.4).